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【兆恒機械】基因分析儀十大常見問題

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  • 添加日(ri)期(qi):2022年(nian)08月12日(ri)

毛細管電泳(CE)基(ji)因分析儀平臺,你(ni)知道有哪些嗎(ma)?

1987年,賽默(mo)飛(fei)Applied Biosystems在(zai)Sanger測序原(yuan)理的(de)基礎上發布第一代真(zhen)正商(shang)業化的(de)自動測序儀。

1996年,推(tui)出310型全自(zi)(zi)動(dong)遺傳分析(xi)儀(yi),實現全部操作(zuo)自(zi)(zi)動(dong)化,包(bao)括(kuo)自(zi)(zi)動(dong)灌膠、自(zi)(zi)動(dong)進(jin)樣、自(zi)(zi)動(dong)數據收集分析(xi)等(deng)。也標(biao)志(zhi)著(zhu)從平板膠進(jin)入毛細管(guan)電泳時代。

隨后,伴(ban)隨著儀器的(de)(de)更新,通量逐(zhu)漸(jian)提高(gao),出現我們(men)常(chang)見的(de)(de)3130系(xi)列、3730系(xi)列以及經(jing)典的(de)(de)3500系(xi)列。其中3500Dx和3500xl Dx基因分析儀已獲得NMPA認(ren)證。

站在巨人的肩膀上,2017年,推出最簡便、自動化程度最高的一款基因分析儀,它就是SeqStudio

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02

基因分析儀的兩大功能,您了解嗎?

經過數十年結果的驗證,Sanger測序是DNA測序的金標準,此外,多重片段分析也是您廣泛應用的遺傳(chuan)分析技術(shu)。

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03

Sanger 測(ce)序的工作流程有哪些(xie),您了解嗎(ma)?

Sanger測序的工作流程從樣本制備到最終數據分析,包括PCR擴增、PCR產物純化、循環測序、測序反應純化、毛細管電泳和數據分析如圖,賽默飛提供Sanger測序全套解決方案

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04

BigDye測序試劑盒(he),V1.1、V3.1、Direct,您get 了(le)嗎?

測序試劑(ji)盒可(ke)以根(gen)據(ju)具(ju)體的(de)實驗需求進行(xing)選擇,可(ke)參(can)考如下的(de)表格:

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* Recommended: ++

* Satisfactory: +

* Not recommended: -

05

Sanger測序(xu)(xu)流程中,循環(huan)測序(xu)(xu)反應時PCR產物的(de)用量究竟要加多少?

不(bu)同(tong)長度的PCR片段對產物的需求量不(bu)一樣,一般可參考(kao)如下(xia)列表:

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06

POP-4、POP-6、POP-7膠,傻傻分不(bu)清楚?

POP4聚合物可實現快速反應,更適合于人類身份鑒定和片段分析。POP6聚合物是進行長片段測序的理想選擇。當和BigDye V1.1一起使用時,POP-6也可以用于測定非常靠近5’端的堿基。POP-7聚合物介于POP-4和POP-6之間,他非常的靈活,適用于很多的應用。


07

片段分(fen)析,通(tong)過分(fen)離(li)熒光(guang)標記的片段并檢測其相對大小,熒光(guang)標記怎么設計?

一種是在引物5’端標記熒光基團,另一種是用熒光標記ddNTP。


5’端(duan)引物標記(ji)通(tong)常(chang)用于微衛星序列分(fen)析;熒光標記(ji)ddNTP通(tong)常(chang)用于SNaPshot多重(zhong)分(fen)析。

08

片段分析數據信號強度的范圍是多少?

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09

片段(duan)分析(xi)實(shi)驗常用的熒(ying)光染料組合有哪(na)些?分別包含哪(na)些熒(ying)光染料?


片段分析實驗常用的熒光染料組合為G5和E5。

G5染料組合包括6-FAM、VIC、NED、PET和LIZ,通常(chang)用于微衛星序列(lie)分析。

E5染料組合包括dR110、dR6G、dTAMRA、dROX和LIZ,主要用于SNaPshot 重(zhong)分析。


10

基(ji)因分析(xi)儀上的數據,選擇什么軟件(jian)分析(xi)?

· 測序數據.ab1文件建議用Sequence Analysis軟件進行分析;

· 片段分析數據.fsa文件建議用GeneMapper軟件進行分析;

· 人類鑒定數據.hid文件建議用GeneMapper ID-X軟件進行分析